VGLII - Laboratorio Genética Virtual versión II

Metas y objetivos del lab
Modelos genéticos hallados en VGLII
Corriendo el programa VGLII - Genética Virtual Laboratorio II
Como comenzar un nuevo problema
Cajas en modo regular
Cajas en modo de práctica
Como abrir un trabajo guardado previamente
Como guardar un trabajo que está en progreso
Como guardar tu trabajo utilizando un nuevo nombre
Como cerrar un problema que está en progreso
Como cruzar dos organismos
Como usar "Super Cross"
Como imprimir el trabajo realizado
Como imprimir un archivo
Como resumir los resultados de un grupo de cajas
Como cerrar/reabrir cajas
Como reorganizar cajas
Como obtener los detalles de cada fenotipo
Como usar el Modelo "Builder"
Como obtener los detalles de VGLII



Metas y objetivos del laboratorio

Al comenzar el problema se te da una jaula o caja con una población de criaturas que fueron colectadas en el campo. Cada una de estas criaturas demuestra una de dos características diferentes de un carácter particulares (por ejemplo, si el carácter es Color del Cuerpo, las características podrían ser Cuerpo Rojo y Cuerpo Verde). Tu tarea es descubrir como estas características son heredadas. Tú determinas esto cruzando individuos y observando su descendencia. Después usas los datos obtenidos para deducir los modelos genéticos que determinan la herencia de estos caracteres. Tú tienes que decidir cuando tienes suficiente información para estar convencido de saber la respuesta - el programa no te dirá la respuesta (excepto cuando está en Modo de Práctica).

Cuando comienzas un nuevo problema,VGLII escoge al azar uno de tres caracteres y un modelo genético. La gama de posibles modelos es configurada por tu instructor cuando se crea el tipo de problema; diferentes tipos de problemas pueden tener un mayor o menor número de posibles modelos y el Modo de Práctica puede ser habilitado o deshabilitado para un tipo de problema en particular. Ya que éste los asigna al azar,la misma característica puede ser heredada en diferentes formas en los diferentes problemas.

Luego, VGLII escoge características particulares de cada carácter y las asigna al azar a genotipos particulares. Cuando una población de individuos con genotipos al azar ha sido generada; estos individuos son puestos en la Caja 1.

Tu tarea es cruzar individuos de diferentes cajas y observar la descendencia resultante. De estos datos, debes determinar los modelos genéticos de como esas características particulares son heredadas.


Los Modelos Genéticos hallados en VGL

Todos los problemas en VGLII envuelven modelos genéticos con genes que tienen dos o tres alelos. Basado en esto, hay algunas características que pueden variar:


Corriendo el programa VGLII - Laboratorio de Genética Virtual

Para correr el programa simplemente haga un doble clic en el archivo VGLIIx.x. Nota: Asegúrese de tener la carpeta de Problemas en la misma carpeta que el archivo VGLIIx.x. Los botones de la barra de herramientas son demostrados a continuación:



Como comenzar un nuevo problema

Cuando comiences a trabajar con VGLII debes ver una barra de herramientas como ésta:

Del menú "Archivo", selecciona "Nuevo Problema" o simplemente haz clic en "Nuevo Problema" en la caja de herramientas y debes ver una lista de archivos con diferentes tipos de problemas. Los archivos están enlistados en orden de dificultad. Archivos adicionales pueden ser generados usando el programa VGLAdmin. Selecciona el archivo y haz un clic en "Abrir".

Una vez que comiences un problema, una ventana (Caja 1) se abrirá en la pantalla. Esta caja es el punto de comienzo para tu proyecto. Los organismos podrían ser (no necesariamente) homocigotos.



Cajas en Modo Regular

Una caja en Modo Regular es demostrada a continuación:

Una secuencia de cruzes es demostrada a continuación:

Esto debería ser escrito como:

Cruze 1: 
Padres:	Un macho largo de la Caja 1 X Una hembra doble de la Caja 1

Descendencia:				33 Largo/Uno
(en la Caja 2)				



Cajas en Modo de Práctica

Si tu instructor ha puesto el Modo de Práctica para un problema particular, tú debes ser capaz de ver los detalles de la "respuesta" - el modelo genético para cada carácter y el genotipo de cada organismo.

En modo de práctica, la caja debe verse como ésta:

Esta es la misma forma en la que se verían en Modo Regular.



Como abrir un trabajo que ha sido guardado previamente

Tú puedes usar esta herramienta para encontrar problemas guardados previamente en los cuales tú podrías haber estado trabajando. Para abrir el problema puedes seleccionar "Abrir Problema" desde el menú del "Archivo" o simplemente hacer un clic en "Abrir Problema" en la barra de herramientas. Una ventanilla se abrirá para ayudarte a seleccionar el archivo. Navega hacia el directorio en el cual el problema ha sido guardado. Selecciona el archivo y haces un clic en "Abrir". VGLII leerá el archivo y abrirá el problema en la misma forma o estado* en el que fue guardado anteriormente.

*estado - estado en este contexto se define como la colección entera de cajas creadas por el usuario, incluyendo cajas que fueron creadas por el usuario pero se mantuvieron cerradas durante el curso de este ejercicio. De manera sencilla, esto significa que cuando se abre un problema, VGLII presentará todas las cajas creadas por el usuario hasta el punto en el cual fueron guardadas.



Como guardar el trabajo que está en progreso

Puedes usar esta herramienta para guardar el trabajo realizado en un archivo. Para guardar tu trabajo puedes seleccionar "Salvar" desde el menú del "Archivo" o simplemente hacer un clic en "Salvar" en la barra de herramientas. Una ventanilla se abrirá para ayudarte a guardar tu trabajo en un archivo en el directorio que selecciones. Navega hacia el directorio en el cual tú quieres salvar tu trabajo. En el espacio de "Nombre del archivo" escribe el nombre del archivo con el cual tu quieres salvar tu trabajo. Luego haz un clic en el botón de "Abrir". Esto crea y abre un archivo con el nombre especificado en el espacio y guarda tu trabajo. El archivo debe tener una extensión ".wrk"



Como guardar tú trabajo bajo un nuevo nombre

Es igual a "Como Guardar un Problema" excepto que éste crea una copia del archivo que ya ha sido creado pero con un nombre diferente.



Como cerrar un problema en progreso

Puedes usar esta herramienta para cerrar un problema en el cual has estado trabajando. Para cerrar el problema en el que has estado trabajando selecciona "Cerrar Problema" desde el menú "Archivo" o simplemente haz un clic en "Cerrar" en la barra de herramientas. Se abrirá una ventanilla para confirmar tu decisión de cerrar el problema. Si seleccionas "Sí" y si tienes trabajo sin salvar entonces la aplicación te sugerirá salvarlo. Si seleccionas "Sí" entonces una ventanilla aparecerá para ayudarte a salvar tu trabajo en un archivo en el directorio que selecciones. Si seleccionas "No" la aplicación cerrará el problema sin salvar el trabajo.



Como cruzar dos organismos

Para cruzar dos organismos selecciona un organismo macho y uno hembra de cualquiera de las cajas abiertas (pueden ser de diferentes cajas). Para cruzar estos organismos y crear la descendencia que ellos producirían, selecciona "Cruze Dos" del menú de "Utilidades" o haga un clic en "Cruze" en la barra de herramientas. Esto creará una nueva caja que contiene los descendientes de los dos padres usados en este cruze.



Como usar "Super Cross"

Super Cross te permite simular muchas réplicas de un cruce particular. Esto te permite obtener un gran numero de descendientes para analisis estadisticos. Selecciona 2 organismos para el cruce y luego elige "Super Cross" del menu "Utilities". Se te pedira seleccionar el numero de descendientes para el Super Cross. Por favor observa que, en el mundo real, esto seria muy caro y llevaria mucho tiempo; debes usarlo con moderacion.



Como imprimir el trabajo realizado

Para imprimir la población hallada en el campo (Caja 1) y todas las cajas generadas, haz un clic en "Imprimir" (demostrado a la izquierda), o seleccione "Imprimir trabajo" desde el menú de "Archivo". Quizás necesites programar la impresora; selecciona "Configurar página" del "Archivo".



Como imprimir a un archivo

Puedes usar esto para guardar tu trabajo en un archivo en un formato fácil de imprimir; este archivo puede ser abierto en cualquier web-browser y muchos procesadores "word". Para imprimir un archivo selecciona "Imprimir a un archivo" desde el menú del "Archivo" o haz un clic en "Imprimir a un archivo" en la barra de herramientas. Esto debe abrir una ventana la cual te permitirá darle un nombre al archivo y escoger un destino. Una vez que se le da un nombre al archivo y has decidido el destino haz un clic en el botón de "Imprimir". Tu trabajo será salvado en un formato fácil de imprimir. El archivo debe tener una extensión ".html"



Como resumir los resultados de un grupo de cajas

Seleccionando una o más Cajas y usando "Crear resumen " del menú de Utilidades, puedes hacer que VGLII cuente el número de organismos de cada tipo hallado en las cajas seleccionadas.

Primero, haz un doble clic en cada una de las cajas que desees seleccionar para el resumen; su borde interno se tornará rojo lo cual demuestra que han sido seleccionadas. Puedes deseleccionar la caja escogida haciendo un doble clic en ésta; también puedes quitar la selección de todas las cajas escogiéndolo "Deseleccionar todo" desde el menú de utilidades.

Una vez que has seleccionado un grupo de Cajas, escoge "Crear resumen Chart" del menú de Utilidades y verás algo como esto:

La información en el tope de la caja muestra que éste fue un resumen de las cajas 6, 7, 8, 9, & 10. Estos organismos fueron producidos de los cruzes de dos padres heterocigotos; entonces, deberíamos esperar una razón 3:1. La razón observada fue 111:37.

Puedes escoger cuales caracteres quieres resumir al seleccionar los caracteres apropiados en la parte de arriba del resumen.



Como Cerrar/Reabrir Cajas

Puedes usar esta herramienta para cerrar/reabrir cualquiera de las cajas creadas hasta ahora. Seleccione "Cajas" del menú de "Utilidades". Una ventana debe abrirse con un listado de todas las cajas creadas hasta ahora. Las que están visibles serán verificadas. Haga un clic en la opción de "Visibilidad" al lado de cada listado de cajas para hacer esa Caja visible/invisible.



Como Reorganizar las cajas

Puedes usar esta herramienta para reorganizar las cajas creadas en una forma ordenada. Selecciona "Reordenar Cajas" del menú de "Utilidades". Todas las cajas visibles deben ser alineadas una bajo la otra y de izquierda a derecha.



Como obtener los detalles acerca del fenotipo

Para obtener más detalles y un diagrama detallado sobre el fenotipo de los organismos en una caja, puedes hacer un clic en la imagen del fenotipo demostrado en la caja. Esto debe abrir una ventana con una imagen agrandada y más detallada del organismo destacando el fenotipo en cuestión. Nota que estas imágenes son sencillas; solo están diseñadas para ilustrar como el fenotipo combinado podría verse. Uno es demostrado a continuación:



Como usar el Modelo "Builder"

Se accede al Modelo Builder a partir del menu "Utilities". Te permite especificar los detalles del modelo genético en tu problema. Empiezas designando caracteristicas generales del modelo; éstas te llevan luego a mas detalles. También puedes designar algunos cruces que den infomacion importante para tu modelo. Tu instructor puede pedirte rellenar el Modelo Builder para calificar tu trabajo.



Como obtener detalles sobre VGL

To get more details about the VGLII application you can select "About VGLII" from the "Help"Para obtener más detalles sobre la aplicación VGLII puedes seleccionar "Acerca de VGLII" del menú "Ayuda" o simplemente haga un clic en el botón "Acerca de VGL". Esto debe abrir una ventana de información.